| دانشگاه مادر | دانشگاههای علوم پزشکی دولتی برتر (تهران، بهشتی و…) | دانشگاه آزاد اسلامی |
| اعتبار مدرک | بسیار بالا (برند دانشگاه دولتی مادر) | بسیار خوب و کاملا معتبر |
| رتبه قبولی لازم | بسیار سختگیرانهتر (رتبه کشوری بهتر نیاز دارد) | کمی آسانتر (رتبه کشوری پایینتر را میپذیرد) |
| شهریه | به طور کلی بالاتر از دانشگاه آزاد است | به طور کلی پایینتر از پردیس خودگردان است |
| کیفیت آموزش | معمولاً بالاتر (بهرهمندی از اساتید دانشگاه مادر) | کیفیت خوب و استاندارد |
| امکانات و تجهیزات | بسیار خوب و مدرن | در واحدهای برتر (تهران) بسیار خوب، در سایر واحدها متغیر |